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希伯来大学-3D水凝胶单细胞培养研究
2022-12-09520次
Bavli等人基于液滴微流控技术,研发了一种名为“CloneSeq”的高灵敏单细胞分析平台,可用于3D细胞培养的全面表征,揭示了新的癌症特异性亚群的存在,并于2021年在Dev. Cell期刊发表论文(影响引子12.861,论文链接见文末)。

Bavli等人基于液滴微流控技术,研发了一种名为“CloneSeq”的高灵敏单细胞分析平台,可用于3D细胞培养的全面表征,揭示了新的癌症特异性亚群的存在,并于2021年在Dev. Cell期刊发表论文(影响引子12.861,论文链接见文末)。

 Epigenomics Ram Laboratory RNA Sequencing.png

(科学家和他们的微流控实验平台:为了实现稳定又精确的微流体控制,获取误差最小的数据,他们采购了几十个法国Fluigent的压力泵、流量计和旋转阀等部件,搭建了一套通用型微流控综合实验平台)


Bavli等人的实验大致可分为两步:

第1步,在3D水凝胶中完成单细胞的封装,并进行克隆扩增,流速范围为8至34μL/min,每秒生成700个水凝胶微球。

 

(水凝胶单细胞封装方案示意图)

 

(单细胞封装与克隆示意图)


第2步,进行克隆分析,作者设计了另一种微流体方案来捕获微滴中的克隆,并使用InDrops protocol对其进行条码化。

 

(InDrops protocol的微流体方案)

 

(捕捉到的图像:Single Clone和Barcode Bead被封装于同一微滴)


实验完成后,作者使用Fluigent十转一阀门M-Switch清洗方案,自动完成实验仪器和管路的清洗。

 m-switch 清洗.jpg


论文:Bavli, D. et al. CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones. Dev. Cell (2021).

DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.026


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